سازمان پزشکان بدون مرز به دلیل سکوت خود در برابر حملات به بیمارستانها در غزه مورد انتقاد قرار گرفته است. بیمارستان شفای غزه که به عنوان یک مرکز درمانی فعالیت میکند، به ادعای برخی، دارای لانچر موشک و بازداشتگاه موقت برای فلسطینیهایی است که با حماس همکاری نمیکنند. همچنین، زیرزمین این بیمارستان به تونلهای حماس متصل است.
با این حال، اکانتهای شبکه اجتماعی این سازمان تا کنون در مورد حملات سرکوبگران به بیمارستانها، شلیک گاز اشکآور، دزدیدن بیماران و بازداشت پزشکان و پرستاران به جرم درمان مجروحین، هیچ واکنشی نشان ندادهاند. تنها در وبسایت این سازمان، چند خط با نگرانی از وضعیت موجود نوشته شده است.
سازمان پزشکان بدون مرز به نظر میرسد که مرزبندی شفافی با فجایعی که ممکن است به نفع چپها باشد، دارد. این در حالی است که انتقادات به سکوت این سازمان در برابر نقض حقوق بشر در غزه افزایش یافته است.